Гистондеацетилаза 1

Гистондеацетилаза 1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 1TYI, 4BKX
Идентификаторы
Символ	HDAC1 ; GON-10; HD1; RPD3; RPD3L1
Внешние ID	OMIM: 601241 MGI: 108086 HomoloGene: 68426 ChEMBL: 325 GeneCards: Ген HDAC1
номер EC	3.5.1.98
Генная онтология Функция • transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding • core promoter binding • RNA polymerase II repressing transcription factor binding • RNA polymerase II transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding transcription factor activity • histone deacetylase activity • protein binding • transcription factor binding • deacetylase activity • enzyme binding • nucleosomal DNA binding • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • protein deacetylase activity • activating transcription factor binding • histone deacetylase binding • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K9 specific) • NAD-dependent histone deacetylase activity (H4-K16 specific) • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K18 specific) Компонент клетки • histone deacetylase complex • nuclear chromatin • nucleus • nucleoplasm • nucleolus • cytoplasm • cytosol • Sin3 complex • NuRD complex • protein complex Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • mitotic cell cycle • chromatin remodeling • transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • protein deacetylation • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Notch signaling pathway • blood coagulation • positive regulation of cell proliferation • epidermal cell differentiation • gene expression • negative regulation of myotube differentiation • positive regulation of receptor biosynthetic process • viral process • chromatin modification • histone deacetylation • circadian regulation of gene expression • odontogenesis of dentin-containing tooth • embryonic digit morphogenesis • ATP-dependent chromatin remodeling • negative regulation of apoptotic process • negative regulation by host of viral transcription • negative regulation of cell cycle • negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • hair follicle placode formation • eyelid development in camera-type eye • fungiform papilla formation • histone H3 deacetylation • histone H4 deacetylation Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	3065	433759
Ensembl	ENSG00000116478	ENSMUSG00000028800
UniProt	Q13547	O09106
RefSeq (мРНК)	NM_004964	NM_008228
RefSeq (белок)	NP_004955	NP_032254
Локус (UCSC)	Chr 1: 32.76 – 32.8 Mb	Chr 4: 129.52 – 129.54 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

Гистондеацетилаза 1  — фермент, который у человека кодируется геном HDAC1 .

Функция

Ацетилирование гистонов и деацетилирование, катализ мультисубъединичных комплексов, ключевая роль в регуляции в экспрессии эукариотических генов. Белок, кодируемый этим геном относится к семейству гистондезацетилаза/acuc/apha и является составной частью гистондезацетилазного комплекса. Он также взаимодействует с белком-супрессором опухоли ретинобластомы, и этот комплекс является ключевым элементом в управлении клеточной пролиферацией и дифференцировкой. Вместе с метастазосвязанным белком-2 MTA2, деацетилирует p53 и модулирует его действие на рост клеток и апоптоз.

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при исследовании функции HDAC1. Условная линия нокаутных мышей, под названием Hdac1^{tm1a(EUCOMM)Wtsi} была создана в рамках международной программы консорциума Нокаутная мышь  — проект мутагенеза высокой пропускной способности для создания и распространения животных моделей для изучения болезней заинтересованными учеными — в институте Сенгера. Мужские и женские особи прошли стандартное фенотипическое обследование для определения последствий удаления. Двадцать пять испытаний были проведены и два фенотипа оказались с отклонениями. Сокращение числа гомозиготных мутантов были определены у эмбрионов во время беременности, и никто не дожил до конца лактации. Остальные испытания проводились на гетерозиготных мутантах взрослых мышей, и не было обнаружено каких-либо существенных отклонений у этих животных.

Взаимодействия

HDAC 1,как было выявлено, взаимодействует с:

Литература