Тимопоэтин

Тимопоэтин
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1GJJ, 1H9F, 1H9E
Идентификаторы
Псевдонимы	TMPO, CMD1T, LAP2, LEMD4, PRO0868, TP, thymopoietin
Внешние ID	OMIM: 188380 MGI: 106920 HomoloGene: 31144 GeneCards: TMPO
Расположение гена (человек) Хр. 12-я хромосома человека Локус 12q23.1 Начало 98,515,579 bp Конец 98,550,351 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 10-я хромосома мыши Локус 10 C2|10 45.66 cM Начало 90,983,433 bp Конец 91,017,177 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) н/д Наибольшая экспрессия в otic placode saccule maxillary prominence BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция ДНК-связывающий lamin binding cadherin binding связывание с белками плазмы Компонент клетки хроматин ядерная оболочка клеточное ядро хромосома цитоплазма часть мембраны внутренняя ядерная мембрана ядерная мембрана мембрана Биологический процесс ДНК-зависимая регуляция транскрипции Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 7112 21917 Ensembl ENSG00000120802 ENSMUSG00000019961 UniProt P42166 P42167 Q61029 Q61033 RefSeq (мРНК) NM_001032283 NM_001032284 NM_001307975 NM_003276 NM_001080129 NM_001080130 NM_001080131 NM_001080132 NM_001080134 NM_011605 NM_001283048 RefSeq (белок) NP_001027454 NP_001027455 NP_001294904 NP_003267 NP_001027454.1 NP_001027455.1 NP_001294904.1 NP_001027454.1 NP_001073598 NP_001073599 NP_001073600 NP_001073601 NP_001269977 NP_035735 NP_035735.2 Локус (UCSC) Chr 12: 98.52 – 98.55 Mb Chr 10: 90.98 – 91.02 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Тимопоэтин (англ. thymopoietin) — это ген человека и его белковый продукт, гормон, который синтезируется в клетках тимуса и принимает участие в контроле дифференцировки Т-лимфоцитов кластера дифференцировки CD90. Пре-мРНК гена тимопоэтина подвергается альтернативному сплайсингу, при этом образуются три различных мРНК, и соответственно, три формы белка—массой 75 кДа (альфа-форма), 51 кДа (бета-форма) и 39 кДа (гамма-форма), которые экспрессируются во всех клетках. Ген тимопоэтина человека локализован на двенадцатой хромосоме (участок 12q22) и состоит из восьми экзонов.

Альфа-форма белка представлена в ядре лимфоцитов, в то время как бета- и гамма-формы локализованы в ядерной мембране. Бета-форма белка является гомологом мышиного белка LAP2 (полипептид, связанный ламиной 2), который играет роль в регуляции ядерной архитектуры, связывая ламин В1 и хромосомы. Данное взаимодействие регулируется в ходе митоза путём фосфорилирования.

Литература

• Harris C.A., Andryuk P.J., Cline S.W., Mathew S., Siekierka J.J., Goldstein G. Structure and mapping of the human thymopoietin (TMPO) gene and relationship of human TMPO beta to rat lamin-associated polypeptide 2 (англ.) // Genomics : journal. — 1995. — Vol. 28, no. 2. — P. 198—205. — doi:10.1006/geno.1995.1131. — PMID 8530026.
• Dechat T., Vlcek S., Foisner R. Review: lamina-associated polypeptide 2 isoforms and related proteins in cell cycle-dependent nuclear structure dynamics. (англ.) // Journal of Structural Biology : journal. — 2000. — Vol. 129, no. 2—3. — P. 335—345. — doi:10.1006/jsbi.2000.4212. — PMID 10806084.
• Twomey J.J., Goldstein G., Lewis V.M., et al. Bioassay determinations of thymopoietin and thymic hormone levels in human plasma. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1977. — Vol. 74, no. 6. — P. 2541—2545. — doi:10.1073/pnas.74.6.2541. — PMID 302007.
• Heavner G.A., Audhya T., Goldstein G. Peptide analogs of thymopentin distinguish distinct thymopoietin receptor specificities on two human T cell lines. (англ.) // Regul. Pept. : journal. — 1990. — Vol. 27, no. 2. — P. 257—262. — doi:10.1016/0167-0115(90)90044-W. — PMID 2158125.
• Audhya T., Schlesinger D.H., Goldstein G. Isolation and complete amino acid sequence of human thymopoietin and splenin. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1987. — Vol. 84, no. 11. — P. 3545—3549. — doi:10.1073/pnas.84.11.3545. — PMID 3473468.
• Fuccello A., Audhya T., Talle M.A., Goldstein G. Immunoassay for bovine serum thymopoietin: discrimination from splenin by monoclonal antibodies. (англ.) // Archives of Biochemistry and Biophysics : journal. — Elsevier, 1984. — Vol. 228, no. 1. — P. 292—298. — doi:10.1016/0003-9861(84)90070-5. — PMID 6364989.
• Harris C.A., Andryuk P.J., Cline S., et al. Three distinct human thymopoietins are derived from alternatively spliced mRNAs. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1994. — Vol. 91, no. 14. — P. 6283—6287. — doi:10.1073/pnas.91.14.6283. — PMID 7517549.
• Hara H., Hayashi K., Ohta K., et al. A new thymopoietin precursor gene from human thymus. (англ.) // Biochem. Mol. Biol. Int. : journal. — 1995. — Vol. 34, no. 5. — P. 927—933. — PMID 7703909.
• Goldstein G., Schlesinger D.H., Audhya T. Isolation and complete amino acid sequence of human thymopoietin and splenin. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1994. — Vol. 91, no. 13. — P. 6249. — doi:10.1073/pnas.91.13.6249. — PMID 8016147.
• Harris C.A., Andryuk P.J., Cline S.W., et al. Structure and mapping of the human thymopoietin (TMPO) gene and relationship of human TMPO beta to rat lamin-associated polypeptide 2. (англ.) // Genomics : journal. — 1996. — Vol. 28, no. 2. — P. 198—205. — doi:10.1006/geno.1995.1131. — PMID 8530026.
• Andersson B., Wentland M.A., Ricafrente J.Y., et al. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction. (англ.) // Analytical Biochemistry : journal. — 1996. — Vol. 236, no. 1. — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
• Berger R., Theodor L., Shoham J., et al. The characterization and localization of the mouse thymopoietin/lamina-associated polypeptide 2 gene and its alternatively spliced products. (англ.) // Genome Research : journal. — 1996. — Vol. 6, no. 5. — P. 361—370. — doi:10.1101/gr.6.5.361. — PMID 8743987.
• Yu W., Andersson B., Worley K.C., et al. Large-scale concatenation cDNA sequencing. (англ.) // Genome Research : journal. — 1997. — Vol. 7, no. 4. — P. 353—358. — PMID 9110174.
• Furukawa K., Fritze C.E., Gerace L. The major nuclear envelope targeting domain of LAP2 coincides with its lamin binding region but is distinct from its chromatin interaction domain. (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 7. — P. 4213—4219. — doi:10.1074/jbc.273.7.4213. — PMID 9461618.
• Furukawa K., Kondo T. Identification of the lamina-associated-polypeptide-2-binding domain of B-type lamin. (англ.) // FEBS Journal : journal. — 1998. — Vol. 251, no. 3. — P. 729—733. — doi:10.1046/j.1432-1327.1998.2510729.x. — PMID 9490046.
• Dechat T., Gotzmann J., Stockinger A., et al. Detergent-salt resistance of LAP2alpha in interphase nuclei and phosphorylation-dependent association with chromosomes early in nuclear assembly implies functions in nuclear structure dynamics. (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1998. — Vol. 17, no. 16. — P. 4887—4902. — doi:10.1093/emboj/17.16.4887. — PMID 9707448.
• Furukawa K. LAP2 binding protein 1 (L2BP1/BAF) is a candidate mediator of LAP2-chromatin interaction. (англ.) // Journal of Cell Science : journal. — The Company of Biologists, 1999. — Vol. 112 ( Pt 15). — P. 2485—2492. — PMID 10393804.
• Weber P.J., Eckhard C.P., Gonser S., et al. On the role of thymopoietins in cell proliferation. Immunochemical evidence for new members of the human thymopoietin family. (англ.) // Biological Chemistry : journal. — 1999. — Vol. 380, no. 6. — P. 653—660. — doi:10.1515/BC.1999.081. — PMID 10430029.
• Dechat T., Korbei B., Vaughan O.A., et al. Lamina-associated polypeptide 2alpha binds intranuclear A-type lamins. (англ.) // Journal of Cell Science : journal. — The Company of Biologists, 2000. — Vol. 113 Pt 19. — P. 3473—3484. — PMID 10984438.
• Martins S.B., Eide T., Steen R.L., et al. HA95 is a protein of the chromatin and nuclear matrix regulating nuclear envelope dynamics. (англ.) // Journal of Cell Science : journal. — The Company of Biologists, 2001. — Vol. 113 Pt 21. — P. 3703—3713. — PMID 11034899.