Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.

Колимовирусы
Колимовирусы | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Научная классификация | ||||||||
Группа:
Реалм:
Царство:
Pararnavirae
Тип:
Artverviricota
Класс:
Порядок:
Семейство:
Колимовирусы
|
||||||||
Международное научное название | ||||||||
Caulimoviridae | ||||||||
Группа по Балтимору | ||||||||
VII: дцДНК-ОТ-вирусы | ||||||||
|
Колимовирусы (лат. Caulimoviridae) — семейство ДНК-содержащих вирусов растений с механизмом обратной транскрипции и двуцепочечной ДНК, то есть вирусов, содержащих стадию обратной транскрипции в своём репликативном цикле.
Содержание
Структура вирионов
Вирион является простым, без липидной оболочки. Морфология нуклеокапсида представлена 2 основными формами: палочковидной и икосаэдрической. Форма нуклеокапсида зависит от размера вируса. Вирионы палочковидной формы имеют диаметр приблизительно 35—50 нм и могут быть в длину до 900 нм. Икосаэдрический капсид имеет диаметр 45—50 нм и примерно такую же длину.
Структура генома и репликация
Геном данного вируса представляет собой несегментированную линейную или циклическую двуцепочечную ДНК. Размер генома насчитывает приблизительно 6—8 kbs. В зависимости от вируса геном может иметь либо одну открытую рамку считывания (ORF), как например у Petuvirus, или больше восьми как у Soymovirus. Геном данного вирусного семейства кодирует такие белки: обратная транскриптаза, протеаза, структурные белки, а также остальные белки с неизвестными функциями, но так или иначе нужные для репликации вируса.
Репликация происходит как в цитоплазме, так и в ядре клетки-хозяина. Сначала, вирусный геном попадает в цитоплазму. Там он формирует суперскрученную минихромосому. На ней транскибируется мРНК вируса, которая избыточна (потому что в некоторые части генома експресируются дважды). Эта транскибируемая РНК попадает в цитоплазму, где она играет две роли. Она может использоваться либо как шаблон для трансляции вирусных белков, либо подвергаться обратной транскрипции до дцДНК, с помощью вирусной ревертазы. Так как эти вирусы имеют много общего с ретровирусами, их часто объединяют в группу параретровирусов. Однако здесь существует важное различие между ретровирусами и вирусами семейства Caulimoviridae. В отличие от ретровирусов они не интегрируют свой геном в хромосомы, так как их геном не кодирует фермента интегразы
Однако существуют виды семейства колимовирусов, такие как Petunia vein clearing virus, которые изредка (в основном в стрессовых условиях) могут интегрировать свой геном в хозяйственный геном. Обычно такие провирусы часто называют эндогенными параретровирусами (EPRVs).
Классификация
По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на март 2016 года в семейство включают 8 родов:
- Род Badnavirus (40 видов)
- Типовой вид Commelina yellow mottle virus
- Род Caulimovirus (11 видов)
- Типовой вид Cauliflower mosaic virus
- Род Cavemovirus (2 вида)
- Типовой вид Cassava vein mosaic virus
- Род Petuvirus (1 вид)
- Род Rosadnavirus (1 вид)
- Род Solendovirus (2 вида)
- Типовой вид Tobacco vein clearing virus
- Род Soymovirus (4 вида)
- Типовой вид Soybean chlorotic mottle virus
- Род Tungrovirus (1 вид)
Вид Rose yellow vein virus имеет необычную организацию генома, которое делает его уникальным видом.
Ссылки
- Notes on family; Caulimoviridae. Архивная копия от 17 июля 2010 на Wayback Machine
- Livia Stavolone, Antonio Ragozzino, and Thomas Hohn. (2003). Characterization of Cestrum yellow leaf curling virus: a new member of the family Caulimoviridae. Journal of General Virology 84: 3459—3464.
- 14th Swiss Plant Molecular and Cell Biology Conference, March 2005.