Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
Rosetta@home
Другие языки:

Rosetta@home

Подписчиков: 0, рейтинг: 0
Rosetta@home
Логотип программы Rosetta@home
Скриншот программы Rosetta@home
Тип Предсказание структуры белка, добровольные вычисления и Berkeley Open Infrastructure for Network Computing projects[d]
Разработчик Baker laboratory, Вашингтонский университет, Rosetta Commons
Операционная система Кроссплатформенное программное обеспечение
Первый выпуск 6 октября 2005
Аппаратная платформа BOINC
Последняя версия • Rosetta Beta: 5.98,
• Rosetta Mini: 3.46
Состояние Активное
Лицензия Free for academic and non-profit use, proprietary license available for commercial use
Сайт boinc.bakerlab.org/roset…
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе
Rosetta@home
Изображение логотипа
Rosetta.gif
Платформа BOINC
Объём загружаемого ПО 48 МБ
Объём загружаемых данных задания 2,5 МБ
Объём отправляемых данных задания 6—150 КБ
Объём места на диске 130 МБ
Используемый объём памяти 255 МБ
Графический интерфейс есть
Среднее время расчёта задания 0,5—10 часов (возможно управление временем)
Deadline 10 дней
Возможность использования GPU нет
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе
Файл:Rosetta@home.png
Схематичное изображение процесса вычислений, направленный на решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии — вычисление третичной структуры белков из их аминокислотных последовательностей.

Rosetta@Home — проект добровольных вычислений, направленный на решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии — вычисление третичной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершённому проекту «Геном человека» известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, несуществующих белков. Хотя большая часть проекта ориентируется на фундаментальные исследования в области улучшения точности и надежности методов протеомики, Rosetta@home также способствует прикладным исследованиям для борьбы с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями. Foldit — это видеоигра от Rosetta@Home, которая стремится достичь целей проекта с краудсорсинг подходом.

Результаты вычислений Rosetta@Home не доступны напрямую. Так же, нельзя использовать результаты вычислений собственного компьютера. Однако они используются для большого количества научных публикаций.

По сути Rosetta — это компьютерная программа, основными задачами которой являются:

  • поиск структуры с наименьшей энергией для заданной аминокислотной последовательности для предсказания структуры белка;
  • решение обратной задачи — поиск аминокислотной последовательности с наименьшей энергией для заданной белковой структуры;
  • расчёт взаимодействия комплекса белок-белок.

В данном проекте используется обратная связь по прогнозированию и полученным результатам, чтобы улучшать потенциальные функции и алгоритмы поиска.

Robetta

Университетом Вашингтона так же поддерживается проект Robetta. На сайте проекта любой может запустить расчёт белков. Робетта использует тот же софт, что и Rosetta@home, но не использует ресурсы участников (это планируется в будущем). Результаты расчётов доступны для скачивания не только запустившему задачу, но и любому желающему, однако хранятся на сервере всего неделю.

Результаты, полученные проектом Робетта на данный момент могут быть использованы только в образовательных и исследовательских целях. Для коммерческого использования (например, для изготовления лекарств) предлагается лицензировать rosetta и запускать на собственном оборудовании.

См. также

Ссылки


Новое сообщение