CD47

CD47
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 2JJS, 2JJT, 2VSC, 4CMM, 4KJY, 5IWL
Идентификаторы
Псевдонимы	CD47, IAP, MER6, OA3, CD47 molecule
Внешние ID	OMIM: 601028 MGI: 96617 HomoloGene: 1346 GeneCards: CD47
Расположение гена (человек) Хр. 3-я хромосома человека Локус 3q13.12 Начало 108,043,091 bp Конец 108,091,862 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 16-я хромосома мыши Локус 16|16 B5 Начало 49,620,896 bp Конец 49,735,373 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в germinal epithelium visceral pleura right uterine tube pancreatic epithelial cell Цитоархитектоническое поле Бродмана 23 pancreatic ductal cell Наибольшая экспрессия в medial dorsal nucleus Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция thrombospondin receptor activity связывание с белками плазмы protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion cell-cell adhesion mediator activity Компонент клетки часть мембраны клеточная мембрана часть клеточной мембраны мембрана specific granule membrane tertiary granule membrane экзосома поверхность клетки Биологический процесс integrin-mediated signaling pathway positive regulation of phagocytosis Агрегация клеток extracellular matrix organization positive regulation of inflammatory response positive regulation of T cell activation response to bacterium leukocyte migration позитивная регуляция пролиферации клеток Опсонизация positive regulation of cell-cell adhesion neutrophil degranulation миграция клеток regulation of interferon-gamma production regulation of interleukin-10 production regulation of interleukin-12 production regulation of interleukin-6 production regulation of tumor necrosis factor production heterotypic cell-cell adhesion monocyte extravasation regulation of nitric oxide biosynthetic process positive regulation of stress fiber assembly cellular response to interferon-gamma cellular response to interleukin-1 cellular response to interleukin-12 cell-cell adhesion negative regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 961 16423 Ensembl ENSG00000196776 ENSMUSG00000055447 UniProt Q08722 Q61735 RefSeq (мРНК) NM_001025079 NM_001025080 NM_001777 NM_198793 NM_001382306 NM_010581 NM_001368415 NM_001368416 NM_001368417 NM_001368418 RefSeq (белок) NP_001768 NP_942088 NP_001369235 NP_034711 NP_001355344 NP_001355345 NP_001355346 NP_001355347 Локус (UCSC) Chr 3: 108.04 – 108.09 Mb Chr 16: 49.62 – 49.74 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

CD47 — поверхностный клеточный гликопротеин, играющий роль в межклеточном взаимодействии, предотвращает захват нормальных эритроцитов фагоцитарными клетками. Лиганд рецептора SIRPA (SIRPα, CD172a).

Структура

Белок состоит из 323 аминокислот.

Функции

CD47 играет роль в клеточной адгезии, являясь рецептором для тромбоцитарного THBS1, и в модулировании интегринов. Играет важную роль в формировании памяти и синаптической пластичности в гиппокампе. CD47 является лигандом рецептора SIRPA (SIRPα), связывание с которым блокирует созревание незрелых дендритных клеток и ингибирует образование цитокинов зрелыми дендритными клетками. Взаимодействие с другим рецептором SIRPG способствует межклеточной адгезии. Предотвращает клиренс из крови нормальных эритроцитов.

В марте 2012 года были опубликованы результаты исследования, согласно которым CD47 препятствует фагоцитозу раковых клеток. Блокирование взаимодействий CD47—SIRPα антителами к CD47 позволило уменьшить лейкосаркому у мышей. Более того, опосредованный анти-CD47 антителами фагоцитоз раковых клеток макрофагами, как оказалось, может инициировать противоопухолевый иммунный ответ Т-клеток и на многие другие ранее не поддававшиеся иммунотерапии разновидности рака.

Распределение в тканях

Белок широко представлен в различных тканях взрослого организма. Особенно его много в эпителии и мозге.

Библиография

• Дмитрий Джагаров (2015). CD47 – удостоверение личности на уровне клеток. Academia.edu
• Oldenborg, P. A. (2013). CD47: A Cell Surface Glycoprotein Which Regulates Multiple Functions of Hematopoietic Cells in Health and Disease. ISRN hematology, 2013: 614619. doi: 10.1155/2013/614619
• Soto Pantoja, D. R., Kaur, S., Miller, T. W., et al. & Roberts, D. D. (2013) Leukocyte surface antigen CD47. UCSD Molecule Pages, 2(1), 19-36.
• Brown E.J., Frazier W.A. Integrin-associated protein (CD47) and its ligands. (англ.) // Trends Cell Biol. : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 3. — P. 130—135. — doi:10.1016/S0962-8924(00)01906-1. — PMID 11306274.
• Oldenborg P.A. Role of CD47 in erythroid cells and in autoimmunity. (англ.) // Leuk. Lymphoma : journal. — 2004. — Vol. 45, no. 7. — P. 1319—1327. — doi:10.1080/1042819042000201989. — PMID 15359629.
• Kaczorowski D.J., Billiar T.R. Targeting CD47: NO limit on therapeutic potential. (англ.) // Circ. Res. : journal. — 2007. — Vol. 100, no. 5. — P. 602—603. — doi:10.1161/01.RES.0000261609.44977.25. — PMID 17363705.
• Campbell I.G., Freemont P.S., Foulkes W., Trowsdale J. An ovarian tumor marker with homology to vaccinia virus contains an IgV-like region and multiple transmembrane domains. (англ.) // Cancer Res. : journal. — 1992. — Vol. 52, no. 19. — P. 5416—5420. — PMID 1394148.
• Brown E., Hooper L., Ho T., Gresham H. Integrin-associated protein: a 50-kD plasma membrane antigen physically and functionally associated with integrins. (англ.) // J. Cell Biol. : journal. — 1991. — Vol. 111, no. 6 Pt 1. — P. 2785—2794. — doi:10.1083/jcb.111.6.2785. — PMID 2277087.
• Lindberg F.P., Gresham H.D., Schwarz E., Brown E.J. Molecular cloning of integrin-associated protein: an immunoglobulin family member with multiple membrane-spanning domains implicated in alpha v beta 3-dependent ligand binding. (англ.) // J. Cell Biol. : journal. — 1993. — Vol. 123, no. 2. — P. 485—496. — doi:10.1083/jcb.123.2.485. — PMID 7691831.
• Mawby W.J., Holmes C.H., Anstee D.J., et al. Isolation and characterization of CD47 glycoprotein: a multispanning membrane protein which is the same as integrin-associated protein (IAP) and the ovarian tumour marker OA3. (англ.) // Biochem. J. : journal. — 1995. — Vol. 304 ( Pt 2). — P. 525—530. — PMID 7998989.
• Lindberg F.P., Lublin D.M., Telen M.J., et al. Rh-related antigen CD47 is the signal-transducer integrin-associated protein. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1994. — Vol. 269, no. 3. — P. 1567—1570. — PMID 8294396.
• Gao A.G., Lindberg F.P., Finn M.B., et al. Integrin-associated protein is a receptor for the C-terminal domain of thrombospondin. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 1. — P. 21—4. — doi:10.1074/jbc.271.1.21. — PMID 8550562.
• Cherif-Zahar B., Raynal V., Gane P., et al. Candidate gene acting as a suppressor of the RH locus in most cases of Rh-deficiency. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1996. — Vol. 12, no. 2. — P. 168—173. — doi:10.1038/ng0296-168. — PMID 8563755.
• Chung J., Gao A.G., Frazier W.A. Thrombspondin acts via integrin-associated protein to activate the platelet integrin alphaIIbbeta3. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1997. — Vol. 272, no. 23. — P. 14740—14746. — doi:10.1074/jbc.272.23.14740. — PMID 9169439.
• Jiang P., Lagenaur C.F., Narayanan V. Integrin-associated protein is a ligand for the P84 neural adhesion molecule. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 2. — P. 559—562. — doi:10.1074/jbc.274.2.559. — PMID 9872987.
• Hermann P., Armant M., Brown E., et al. The vitronectin receptor and its associated CD47 molecule mediates proinflammatory cytokine synthesis in human monocytes by interaction with soluble CD23. (англ.) // J. Cell Biol. : journal. — 1999. — Vol. 144, no. 4. — P. 767—775. — doi:10.1083/jcb.144.4.767. — PMID 10037797.
• Chung J., Wang X.Q., Lindberg F.P., Frazier W.A. Thrombospondin-1 acts via IAP/CD47 to synergize with collagen in alpha2beta1-mediated platelet activation. (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology, 1999. — Vol. 94, no. 2. — P. 642—648. — PMID 10397731.
• Longhurst C.M., White M.M., Wilkinson D.A., Jennings L.K. A CD9, alphaIIbbeta3, integrin-associated protein, and GPIb/V/IX complex on the surface of human platelets is influenced by alphaIIbbeta3 conformational states. (англ.) // Eur. J. Biochem. : journal. — 1999. — Vol. 263, no. 1. — P. 104—111. — doi:10.1046/j.1432-1327.1999.00467.x. — PMID 10429193.
• Mateo V., Lagneaux L., Bron D., et al. CD47 ligation induces caspase-independent cell death in chronic lymphocytic leukemia. (англ.) // Nat. Med. : journal. — 1999. — Vol. 5, no. 11. — P. 1277—1284. — doi:10.1038/15233. — PMID 10545994.
• Wu A.L., Wang J., Zheleznyak A., Brown E.J. Ubiquitin-related proteins regulate interaction of vimentin intermediate filaments with the plasma membrane. (англ.) // Mol. Cell : journal. — 1999. — Vol. 4, no. 4. — P. 619—625. — doi:10.1016/S1097-2765(00)80212-9. — PMID 10549293.
• Erb L., Liu J., Ockerhausen J., et al. An RGD sequence in the P2Y(2) receptor interacts with alpha(V)beta(3) integrins and is required for G(o)-mediated signal transduction. (англ.) // J. Cell Biol. : journal. — 2001. — Vol. 153, no. 3. — P. 491—501. — doi:10.1083/jcb.153.3.491. — PMID 11331301.
• Rebres R.A., Vaz L.E., Green J.M., Brown E.J. Normal ligand binding and signaling by CD47 (integrin-associated protein) requires a long range disulfide bond between the extracellular and membrane-spanning domains. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 37. — P. 34607—34616. — doi:10.1074/jbc.M106107200. — PMID 11454874.
• Yuhua Wang, Zhenghong Xu, Shutao Guo, Lu Zhang, Arati Sharma, Gavin P Robertson and Leaf Huang. Intravenous Delivery of siRNA Targeting CD47 Effectively Inhibits Melanoma Tumor Growth and Lung Metastasis (англ.) // Molecular Therapy. : journal. — 2013. — Vol. 21. — P. 1919—1929. — doi:10.1038/mt.2013.135.