Список растений с секвенированным геномом
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
Список растений с секвенированным геномом включает растения, для которых в публичном доступе имеется полная собранная, аннотированная последовательность генома. В список не включены растения геномы, которых не собраны и представлены отдельными последовательностями. Также в представленный список не включены растения для которых доступны только геномы органелл (пластид и митохондрий). Для всех клад живых организмов, см. список секвенированных геномов.
Содержание
Водоросли
В данном случае водоросли понимаются широко, как сборная группа без таксономического значения, объединяющая фотосинтезирующие эукариотические организмы.
| Организм (штамм) | Клада | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cyanophora paradoxa | Glaucophyte (Глаукофитовые водоросли) | Rutgers University | 2012 | ||||
| Bathycoccus prasinos BBAN7 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Сравнительные анализ | 15 Mb | Joint Genome Institute | 2012 | ||
| Chlamydomonas reinhardtii CC-503 cw92 mt+ | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Модельный организм | 111 Mb | 17,737 | University of California at Los Angeles | Chlamydomonas reinhardtii (англ.) на сайте Национального центра биотехнологической информации (NCBI). ENAШаблон:ENA | 2007 |
| Chlorella variabilis NC64A | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | 2010 | |||||
| Coccomyxa subellipsoidea sp. C-169 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Модельный организм (предполагается использование для получения биотоплива) | Joint Genome Institute | 2007 | |||
| Dunaliella salina CCAP19/18 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Галофил, используется для получения биотоплива и синтеза β-каротина | Joint Genome Institute | Organelle genomes complete, nuclear genome in progress | |||
| Micromonas pusilla CCMP1545 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Представитель морского фитопланктона | Joint Genome Institute | 2007 | |||
| Micromonas pusilla RCC299/NOUM17 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Joint Genome Institute | 2007 | ||||
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Простой эукариотический организм с маленьким геномом | 13.2 Mb | 7,796 | 2007 | ||
| Ostreococcus tauri OTH95 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | 2006 | |||||
| Ostreococcus sp. RCC809 | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | 7,773 | Joint Genome Institute | 2008 | |||
| Volvox carteri | Chlorophyta (Зелёные водоросли) | Многоклеточная водоросль, модельный организм | ~131.2 Mb | 14,971 | 2010 | ||
| Chondrus crispus | Rhodophyta (Красные водоросли) | 105 Mb | 9,606 | Genoscope/Station Biologique de Roscoff | 2013 | ||
| Cyanidioschyzon merolae strain:10D | Rhodophyta (Красные водоросли) | 16.73 Mb | 5,017 | 2004, 2007 | |||
| Galdieria sulphuraria | Rhodophyta (Красные водоросли) | Термо-ацидофильный организм (экстремофил) | 13.7 Mb | 6,623 | 2005 2005 2013 | ||
| Porphyridium purpureum | Rhodophyta (Красные водоросли) | 19.7 Mb | 8,355 | 2013 | |||
| Pyropia yezoensis | Rhodophyta (Красные водоросли) | 43 Mb | 10,327 | 2013 | |||
| Ectocarpus siliculosus | Heterokontophyta (Страменопилы) | Представитель из супергруппы SAR | Station Biologique de Roscoff | 2010 |
Мохообразные
| Организм (разновидность, сорт) | Отдел | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Physcomitrella patens ssp. patens str. Gransden 2004 | Bryophyta (Мхи) | Модельное растение, сформировавшегося при ранней дивергенции наземных растений | 2008 |
Высшие растений (сосудистых растений)
| Организм (разновидность, сорт) | Отдел | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sеlaginella moellendorffii (плаунок Мёллендорфа) | Lycopodiophyta (Плауновидные) | Модельный организм | 2011 |
Покрытосеменные
Амборелловые (Amborellales)
| Организм (разновидность, сорт) | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Amborella trichopoda | Amborellaceae (Амборелловые) | Базальные покрытосеменные | 2013 |
Эвдикоты
Лютикоцветные (Ranunculales)
| Организм (разновидность, сорт) | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aquilegia coerulea (водосбор голубой) | Ranunculaceae (Лютиковые) | Базальные эвдикоты | Неизданный геном |
Протеецветные (Proteales)
| Организм (разновидность, сорт) | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Nelumbo nucifera (лотос орехоносный) | Nelumbonaceae (Лотосовые) | Базальные эвдикоты | 2013 |
Гвоздичноцветные (Caryophyllales)
| Организм (разновидность, сорт) | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Beta vulgaris (свекла обыкновенная) | Chenopodiaceae (Маревые) | Сельскохозяйственная культура | 714-758 Мб | 27,421 | 2013 | ||
| Chenopodium quinoa (киноа) | Chenopodiaceae (Маревые) | Сельскохозяйственная культура | 1.39–1.50 Гб | 44,776 | 3,486 подмости, эшафот Н50 в 3.84 Мб, 90% собранного генома содержится в 439 лесов | 2017 | |
| Amaranthus hypocondriacus | Amaranthaceae (Амарантовые) | Сельскохозяйственная культура | 403.9 Мб | 23,847 | 16 крупных лесов от 16.9 до 38,1 Мб. N50 и Л50 сборки 24.4 Мб и 7, соответственно. | 2016 |
Розиды (Rosids)
| Организм (разновидность, сорт) | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Betula nana (карликовая берёза) | Betulaceae (Берёзовые) | Арктический кустарник | 450 Mbp | QMUL/SBCS | 2013 | ||
| Aethionema arabicum | Brassicaceae (Капустные) | Сравнительный анализ геномов Капустных | 2013 | ||||
| Arabidopsis lyrata | Brassicaceae (Капустные) | Модельный организм | 2011 | ||||
| Arabidopsis thaliana экотип: Columbia | Brassicaceae (Капустные) | Модельный организм | 135 Mbp | 2000 | |||
|
Barbarea vulgaris Сурепка обыкновенная
G-type |
Brassicaceae (Капустные) | Модельный организм при изучение специфических ветвей вторичного метаболизма и механизмов защиты от фитопатогенов | 2017 | ||||
| Brassica rapa (репа) | Brassicaceae (Капустные) | Сельскохозяйственная овощная культура и модельное растение | 2011 | ||||
| Capsella rubella (пастушья сумка) | Brassicaceae (Капустные) | Близкий родственник модельного организма Arabidopsis thaliana | 130Mbp | 26,521 | JGI | 2013? 2013 | |
| Eutrema salsugineum (эвтрема) | Brassicaceae (Капустные) | Близкий родственник A. thaliana, обладает высокой солеустойчивостью | 240Mbp | 26,351 | JGI | 2013 | |
| Eutrema parvulum (эвтрема) | Brassicaceae (Капустные) | Сравнительный анализ геномов Капустных | 2013 | ||||
| Leavenworthia alabamica | Brassicaceae (Капустные) | Сравнительный анализ геномов Капустных | 2013 | ||||
| Sisymbrium irio (гулявник) | Brassicaceae (Капустные) | Сравнительный анализ геномов Капустных | 2013 | ||||
| Thellungiella parvula | Brassicaceae (Капустные) | Близкий родственник A. thaliana, обладает высокой солеустойчивостью | 2011 | ||||
| Cannabis sativa (конопля посевная) | Cannabaceae (Коноплёвые) | Сельскохозяйственная техническая и лекарственная культура | ca 820Mbp | 30,074 based on transcriptome assembly and clustering | Illumina/454
scaffold N50 16.2 Kbp |
2011 | |
| Carica papaya (папайя) | Caricaceae (Кариковые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 372Mbp | 28,629 | contig N50 11kbp
scaffold N50 1Mbp total coverage ~3x (Sanger) 92.1% unigenes mapped 235Mbp anchored (of this 161Mbp also oriented) |
2008 | |
| Kalanchoe sp. (каланхое) | Crassulaceae (Толстянковые) | Растение с CAM-метаболизмом | 2013? | ||||
| Citrullus lanatus (арбуз) | Cucurbitaceae (Тыквенные) | Сельскохозяйственная бахчевая культура | ca 425Mbp | 23,440 | BGI | Illumina
coverage 108.6x contig N50 26.38 kbp Scaffold N50 2.38 Mbp genome covered 83.2% ~97% ESTs mapped |
2012 |
| Cucumis melo (дыня)DHL92 | Cucurbitaceae (Тыквенные) | Vegetable crop | 450Mbp | 27,427 | 454
13.5x coverage contig N50: 18.1kbp scaffold N50: 4.677 Mbp WGS |
2012 | |
| Cucumis sativus (огурец) 'Chinese long' inbred line 9930 | Cucurbitaceae (Тыквенные) | Vegetable crop | 350 Mbp (Kmer depth) 367 Mbp (flow cytometry) | 26,682 | contig N50 19.8kbp
scaffold N50 1,140kbp total coverage ~72.2 (Sanger + Ilumina) 96.8% unigenes mapped 72.8% of the genome anchored |
2009 | |
| Hevea brasiliensis (гевея бразильская) | Euphorbiaceae (молочайные) | the most economically important member of the genus Hevea | 2013 | ||||
| Jatropha curcas Palaan | Euphorbiaceae (молочайные) | bio-diesel crop | 2011 | ||||
| Manihot esculenta (маниок съедобный) | Euphorbiaceae (молочайные) | Humanitarian importance | ~760Mb | 30,666 | JGI | 2012 | |
| Ricinus communis (клещевина) | Euphorbiaceae (молочайные) | Oilseed crop | 320Mbp | 31,237 | JCVI | Sanger coverage~4.6x contig N50 21.1 kbp scaffold N50 496.5kbp | 2010 |
| Cajanus cajan (голубиный горох) var. Asha | Fabaceae (Бобовые) | Модельный организм (представитель семейства Бобовые) | 2012 | ||||
| Arachis duranensis (геномный диплоид дикого арахиса) accession V14167 | Fabaceae (Бобовые) | Wild ancestor of peanut, an oilseed and grain legume crop | Illumina 154x coverage, contig N50 22 kbp, scaffold N50 948 kbp | 2016 | |||
| Arachis ipaensis (геномный диплоид дикого арахиса) accession K30076 | Fabaceae (Бобовые) | Wild ancestor of peanut, an oilseed and grain legume crop | Illumina 163x coverage, contig N50 23 kbp, scaffold N50 5,343 kbp | 2016 | |||
| Cicer arietinum (нут бараний) | Fabaceae (Бобовые) | filling | 2013 | ||||
| Cicer arietinum L. (нут бараний) | Fabaceae (Бобовые) | 2013 | |||||
| Glycine max (соя) var. Williams 82 | Fabaceae (Бобовые) | Protein and oil crop | 1115Mbp | 46,430 | Contig N50:189.4kbp
Scaffold N50:47.8Mbp Sanger coverage ~8x WGS 955.1 Mbp assembled |
2010 | |
| Lotus japonicus (лядвенец) | Fabaceae (Бобовые) | Модельный организм (представитель семейства Бобовые) | 2008 | ||||
| Medicago truncatula (люцерна усечённая) | Fabaceae (Бобовые) | Модельный организм (представитель семейства Бобовые) | 2011 | ||||
| Phaseolus vulgaris (фасоль обыкновенная) | Fabaceae (Бобовые) | Модельный организм (представитель семейства Бобовые) | 520Mbp | 31,638 | JGI | 2013? | |
| Linum usitatissimum (лён обыкновенный) | Linaceae (Льновые) | Crop | ~350Mbp | 43,384 | BGI et al. | 2012 | |
| Durio zibethinus (дуриан цибетиновый) | Malvaceae (Мальвовые) | Tropical fruit tree | ~738Mbp | 2017 | |||
| Gossypium raimondii (хлопчатник) | Malvaceae (Мальвовые) | One of the putative progenitor species of tetraploid cotton | 2013? | ||||
| Theobroma cacao (какао) | Malvaceae (Мальвовые) | Flavouring crop | 2010 | ||||
| Theobroma cacao (какао) cv. Matina 1-6 | Malvaceae (Мальвовые) | Most widely cultivated cacao type | 2013 | ||||
| Azadirachta indica (ним) | Meliaceae (Мелиевые) | Source of number of Terpenoids, including biopesticide azadirachtin, Used in Traditional Medicine | 364 Mbp | ~20000 | GANIT Labs | Illumina GAIIx, scaffold N50 of 452028bp, Transcriptome data from Shoot, Root, Leaf, Flower and Seed | 2012 and 2011 |
| Eucalyptus grandis (эвкалипт) | Myrtaceae (Миртовые) | Fibre and timber crop | 2011 | ||||
| Fragaria vesca (земляника лесная) | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная ягодная культура | 240 Mbp | 34,809 | scaffold N50: 1.3 Mbp
454/Illumina/solid 39x coverage WGS |
2011 | |
| Malus domestica (яблоня домашняя) "Golden Delicious" | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | ~742.3 Mbp | 57,386 | contig N50 13.4 (kbp??)
scafold N50 1,542.7 (kbp??) total coverage ~16.9x (Sanger + 454) 71.2% anchored |
2010 | |
| Prunus amygdalus (миндаль) | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2013? | ||||
| Prunus avium (черешня) cv. Stella | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2013? | ||||
| Prunus mume (абрикос японский) | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2012 | ||||
| Prunus persica (персик) | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 265Mbp | 27,852 | Sanger coverage:8.47x
WGS ca 99% ESTs mapped 215.9 Mbp in pseudomolecules |
2013 | |
| Pyrus bretschneideri (белая китайская груша) cv. Dangshansuli | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2012 | ||||
| Pyrus communis (груша обыкновенная) cv. Doyenne du Comice | Rosaceae (Розовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2013? | ||||
| Citrus clementina (клементин) | Rutaceae (Рутовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2013? | ||||
| Citrus sinensis (апельсин) | Rutaceae (Рутовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2013?, 2013 | ||||
| Populus trichocarpa (тополь) | Salicaceae (Ивовые) | Carbon sequestration, model tree, timber | 510 Mbp (cytogenetic) 485 Mbp (coverage) | 73,013 [Phytozome] | Scaffold N50: 19.5 Mbp
Contig N50:552.8 Kbp [phytozome] WGS >=95 % cDNA found |
2006 | |
| Vitis vinifera (виноград культурный) генотип PN40024 | Vitaceae (Виноградовые) | Сельскохозяйственная плодовая культура | 2007 |
Астериды (Asterids)
| Организм | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Mimulus guttatus (губастик) | Phrymaceae (Фримовые) | model system for studying ecological and evolutionary genetics | ca 430Mbp | 26,718 | JGI | Scaffold N50 = 1.1 Mbp
Contig N50 = 45.5 Kbp |
2013? |
| Solanum lycopersicum (томат) cv. Heinz 1706 | Solanaceae (Пасленовые) | Сельскохозяйственная культура | ca 900Mbp | 34,727 | SGN | Sanger/454/Illumina/Solid
Pseudomolecules spanning 91 scaffolds (760Mbp of which 594Mbp have been oriented ) over 98% ESTs mappable |
2011 2012 |
| Solanum pimpinellifolium (Currant Tomato) | Solanaceae (Пасленовые) | closest wild relative to tomato | Illumina
contig N50: 5100bp ~40x coverage |
2012 | |||
| Solanum tuberosum (картофель) | Solanaceae (Пасленовые) | Сельскохозяйственная овощная культура | 844 Mbp kmer (856 Mbp) | 39,031 | PGSC | Sanger/454/Illumina
79.2x coverage contig N50: 31,429bp scaffold N50: 1,318,511bp |
2011 |
| Solanum commersonii (commerson's nightshade) | Solanaceae (Пасленовые) | Wild potato relative | 838 Mbp kmer (840 Mbp) | 37,662 | UNINA, UMN, UNIVR, Sequentia Biotech, CGR | Illumina
105x coverage contig N50: 6,506bp scaffold N50: 44,298bp |
2015 |
|
Nicotiana benthamiana
(табак) |
Solanaceae (Пасленовые) | Close relative of tobacco | ca 3Gbp | Illumina
63x coverage contig N50: 16,480bp scaffold N50:89,778bp >93% unigenes found |
2012 | ||
| Nicotiana sylvestris (табак лесной) | Solanaceae (Пасленовые) | model system for studies of terpenoid production | 2.636Gbp | Philip Morris International | 94x coverage
scaffold N50: 79.7 kbp 194kbp superscaffolds using physical Nicotiana map |
2013 | |
| Nicotiana tomentosiformis | Solanaceae (Пасленовые) | Tobacco progenitor | 2.682 Gb | Philip Morris International | 146x coverage
scaffold N50: 82.6 kb 166kbp superscaffolds using physical Nicotiana map |
2013 | |
|
Capsicum annuum (перец стручковый)
(a) cv. CM334 (b) cv. Zunla-1 |
Solanaceae (Пасленовые) | Food crop | ~3.48 Gbp | (a) 34,903
(b) 35,336 |
N50 contig: (a) 30.0 kb (b) 55.4 kb
N50 scaffold: (a) 2.47 Mb (b) 1.23 Mb |
(a) 2014(b) 2014 | |
| Capsicum annuum var. glabriusculum (Chiltepin) | Solanaceae (Пасленовые) | Progenitor of cultivated pepper | ~3.48 Gbp | 34,476 | N50 contig: 52.2 kb
N50 scaffold: 0.45 Mb |
2014 | |
| Petunia (петуния) | Solanaceae (Пасленовые) | Economically important flower | 2011 | ||||
| Utricularia gibba (пузырчатка) | Lentibulariaceae (Пузырчатковые) | model system for studying genome size evolution; a carnivorous plant | 81.87 Mb | 28,494 | LANGEBIO, CINVESTAV | Scaffold N50: 80.839 Kb | 2013 |
Однодольные
Злакоцветные
| Организм | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Setaria italica (могар) | Poaceae (Злаки) | Model of C4 metabolism | 2012 | ||||
| Aegilops tauschii (эгилопс) | Poaceae (Злаки) | bread wheat D-genome progenitor | ca 4.36Gb | BGI | Non-repetitive sequence assembled | 2013 | |
| Brachypodium distachyon | Poaceae (Злаки) | Model monocot | 2010 | ||||
| Dichanthelium oligosanthes | Poaceae (Злаки) | C3 grass closely related to C4 species | 960 Mb | DDPSC | 2016 | ||
| Hordeum vulgare (ячмень обыкновенный) | Poaceae (Злаки) | Model of ecological adoption | IBSC | 2012 | |||
| Oryza brachyantha (дикий рис) | Poaceae (Злаки) | Disease resistant wild relative of rice | 2013 | ||||
| Oryza glaberrima (африканский рис) var CG14 | Poaceae (Злаки) | West-African species of rice | 2010 | ||||
| Oryza rufipogon (красный рис) | Poaceae (Злаки) | Ancestor to Oryza sativa | 406 Mb | 37,071 | SIBS | Illumina HiSeq2000
100x coverage |
2012 |
| Oryza sativa (рис посевной длиннозёрный) ssp indica | Poaceae (Злаки) | Crop and model cereal | 2002 | ||||
| Oryza sativa (рис посевной короткозерный) ssp japonica | Poaceae (Злаки) | Crop and model cereal | 2002 | ||||
| Panicum virgatum (просо прутьевидное) | Poaceae (Злаки) | biofuel | 2013? | ||||
| Phyllostachys edulis (листоколосник бамбуковый) | Poaceae (Злаки) | 2013 | |||||
| Sorghum bicolor (сорго двуцветное) genotype BTx623 | Poaceae (Злаки) | Crop | ca 730Mbp | 34,496 | contig N50:195.4kbp
scaffold N50: 62.4Mbp Sanger, 8.5x coverage WGS |
2009 | |
| Triticum aestivum (пшеница мягкая) | Poaceae (Злаки) | 20% of global nutrition | Non-repetitive sequence assembled
Roche 454/Illumina WGS |
2012 | |||
| Triticum urartu (пшеница) | Poaceae (Злаки) | Bread wheat A-genome progenitor | ca 4.94Gb | BGI | Non-repetitive sequence assembled
Illumina WGS |
2013 | |
| Zea mays (кукуруза) ssp mays B73 | Poaceae (Злаки) | Cereal crop | 2,300Mbp | 39,656 | contig N50 40kbp
scaffold N50: 76kbp Sanger, 4-6x coverage per BAC |
2009 |
Другие однодольные (не злаки)
| Организм напрягать | Семья | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Musa acuminata (банан заостренный) | Musaceae (Банановые) | А-генома современного банана сорта | 523 Пмб | 36,542 | Н50 контигов: 43.1 Кб
Н50 лески: 1.3 Мб |
2012 | |
| Муса balbisiana (банан Бальбиса) | Musaceae (Банановые) | Б-геном современного банана сорта | 438 Пмб | 36,638 | Н50 контигов: 7.9 Кб | 2013 | |
| Phoenix dactylifera (финиковая пальма) | Arecaceae (Пальмовые) | Древесных растений в засушливых регионах | 658 Пмб | 28,800 | Н50 контигов: 6.4 Кб | 2011 | |
| Elaeis масло (Африканская масличная Пальма) | Arecaceae (Пальмовые) | Масличная культура | ~1800 Пмб | 34,800 | Н50 эшафот: 1.27 Мб | 2013 | |
| Spirodela polyrhiza (многокоренник) | Araceae (Ароидные) | Водное растение | 158 ВР | 19,623 | Н50 эшафот: 3.76 Мб | 2014 | |
| Phalaenopsis equestris (фаленопсис наездник) | Orchidaceae (Орхидные) | Разведение родителем многих современных мотылек орхидеи, сортов и гибридов растений с crassulacean кислотный метаболизм (Кэм) | Пмб 1600 | 29,431 | Н50 эшафот: 359,115 Кб | 2014 |
Голосеменные
| Организм (вид, сорт) | Семейство | Актуальность | Размер генома | Количество предсказанных генов | Организация | Статус сборки | Год завершения сборки и ссылки |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Picea abies (ель европейская) | Pinaceae (Сосновые) | Лесоматериалами, tonewood в, декоративных, таких как Рождественская елка | 20 Гб | 28,354 | Умео Научного Центра Завода / SciLifeLab, Швеция | 2013 | |
| Picea glauca (ель сизая) | Pinaceae (Сосновые) | Лесная, Целлюлозно | 20.8 Гб | 56,064 | Институциональное Сотрудничество | 2013 | |
| Pinus taeda (сосна ладанная) | Pinaceae (Сосновые) | Лесоматериалами | 20.15 Гб | 50,172 | Институциональное сотрудничество | N50 Размер ремонтины: 66.9 кбп | 2014 |
Без рубрики добавить...
геном из Galdieria sulphuraria, наконец, был опубликован (Schönknecht, г., У.-Х. Чен, и соавт. (2013). "Перенос генов от бактерий и архей способствовало эволюции экстремофильных эукариот." Наука 339(6124): 1207-1210.) Размер генома составляет 13.7 МБ, и 6623 белок-кодирующих генов были аннотированы.
Накамура и соавт. опубликовал последовательность генома для Pyropia yezoensis (Накамура, Ю. Н. Сасаки, и соавт. (2013). "Первый симбионт-бесплатные геномной последовательности из морских красных водорослей, Susabi-нори Pyropia yezoensis." Биохимия 8(3): e57122.).
Бхаттачария и соавт. опубликован геном Porphyridium purpureum (Бхаттачарья, Д., Д. С. цена, и соавт. (2013). "Геном красной водоросли Porphyridium purpureum." Природа Коммуникаций 4.)
Пресс-релизы объявляет последовательность
Не соответствует требованиям абзаца первого настоящей статьи в почти полной последовательности с высоким качеством, опубликованные, собранный и общедоступной. Этот список включает в себя виды, где последовательности объявлено в пресс-релизах и сайтах, но не в данных-богатый публикацию в реферируемом журнале с doi.
- Рапс, растительные масла (2009)
- Elaeis масло, масличная Пальма (2007)
- Corchorus olitorius, растительных волокон (2010)
- Эксцельсиор Fraxinus, ясень (2013 проекта)
См. также
- http://plabipd.de/timeline_view.ep
- http://genomevolution.org/wiki/index.php/Sequenced_plant_genomes
- Список эукариот с секвенированным геномом
- Список животных с секвенированных геномом
- Список архей с секвенированным геномом
- Список бактерий с секвенированным геномом
- Список грибов с секвенированным геномом
- Список секвенированных пластомов
- Список протистов с секвенированным геномом