Гентингтин

Гентингтин
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 3IO6, 3IOU, 3LRH, 4FE8, 4FEB, 4FEC, 4FED, 2LD0, 2LD2, 3IO4, 3IOR, 3IOT, 3IOV, 3IOW, 4RAV
Идентификаторы
Псевдонимы	HTT, HD, IT15, huntingtin, LOMARS
Внешние ID	OMIM: 613004 MGI: 96067 HomoloGene: 1593 GeneCards: HTT
Расположение гена (человек) Хр. 4-я хромосома человека Локус 4p16.3 Начало 3,041,363 bp Конец 3,243,957 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 5-я хромосома мыши Локус 5 B2|5 17.92 cM Начало 34,919,084 bp Конец 35,069,878 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в sural nerve body of pancreas stromal cell of endometrium skin of abdomen upper lobe of left lung Наибольшая экспрессия в cerebellar cortex ventromedial nucleus Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция profilin binding dynactin binding transmembrane transporter binding p53 binding transcription factor binding связывание с белками плазмы beta-tubulin binding связывание похожих белков dynein intermediate chain binding kinase binding heat shock protein binding Компонент клетки late endosome аппарат Гольджи нуклеоплазма Аутофагосома Эндоплазматический ретикулум центриоль cytoplasmic vesicle membrane дендрит цитозоль аксон клеточное ядро цитоплазма Тельца включения perinuclear region of cytoplasm protein-containing complex presynaptic cytosol postsynaptic cytosol Биологический процесс развитие органа животных retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum Golgi organization vesicle transport along microtubule negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway establishment of mitotic spindle orientation positive regulation of cilium assembly positive regulation of inositol 1,4,5-trisphosphate-sensitive calcium-release channel activity апоптоз vocal learning positive regulation of lipophagy positive regulation of autophagy of mitochondrion positive regulation of aggrephagy regulation of phosphoprotein phosphatase activity protein destabilization positive regulation of apoptotic process regulation of CAMKK-AMPK signaling cascade regulation of cAMP-dependent protein kinase activity Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 3064 15194 Ensembl ENSG00000197386 ENSMUSG00000029104 UniProt P42858 P42859 RefSeq (мРНК) NM_002111 NM_001388492 NM_010414 RefSeq (белок) NP_002102 NP_034544 Локус (UCSC) Chr 4: 3.04 – 3.24 Mb Chr 5: 34.92 – 35.07 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

Гентингтин (англ. Huntingtin) — это белок, закодированный геном HTT (также HD). Функция нормальной формы этого белка неизвестна. Мутации в гене вызывают болезнь Гентингтона.

Структура

Структура белка гентингтина может быть самой разной, так как из-за полиморфизма гена в белке содержится разное количество остатков глутамина. Обычно их содержится от 6 до 35 (наибольшее зарегистрированное количество — около 250). Молекулярная масса хантингтина в основном зависит именно от количества остатков глутамина. Белок обычно содержит 3144 аминокислоты.

Функция белка

Главная функция гентингтина точно не выяснена, однако достоверно известно, что он играет важную роль в нервных клетках. Внутри них он участвует в передаче сигналов, транспорте веществ, скреплении белков и защите клеток от апоптоза. Также известно, что белок повышает экспрессию BDNF на уровне транскрипции, однако механизм, с помощью которого гентингтин это делает, не установлен. Гентингтин также необходим для нормального протекания эмбриогенеза, в экспериментах на мышах при отсутствии гомологичного гена эмбрион быстро погибал.

Взаимодействие с другими белками

Установлено, что гентингтин может непосредственно взаимодействовать с 19 видами белков. Шесть из них используются в регуляции транскрипции, другие четыре — в транспорте веществ, ещё три — в передаче сигналов, а у остальных шести функция неизвестна.

Болезнь Гентингтона

Болезнь Гентингтона возникает, если в гене вследствие мутации 36 раз и более встречается кодон CAG, кодирущий глутамин, из-за чего в белке происходит удлинение полиглутаминовой последовательности в N-конце, то есть глутаминовых остатков становится больше нормы, которая находится в диапазоне 6-35 остатков. В этом случае вместо нормального белка гентингтина Htt образуется его изменённый из-за мутации вариант mHtt. Считается, что болезнь Гентингтона возникает именно из-за усиления токсического эффекта mHtt.

Классификация нуклеотидной последовательности и статус болезни, который зависит от числа кодонов CAG

Ссылки

• Huntingtin+protein,+human at the US National Library of Medicine Medical Subject Headings
• The Huntingtin Protein and Protein Aggregation at HOPES : Huntington’s Outreach Project for Education at Stanford
• The HDA Huntington’s Disease Association UK
• GeneCard
• iHOP